《表5 排行前10位的代谢通路》

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《美国红枫叶片转录组分析》


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将美国红枫unigenes在KEGG数据库中进行对比,共有16 095条unigenes注释信息。在红叶和花叶对比,318条获得注释的差异表达基因可以分配到104条KEGG通路中;在红叶和青叶对比,459条获得注释的差异表达基因可以分配到107条KEGG通路中;在花叶和青叶对比,48条获得注释的差异表达基因可以分配到47条KEGG通路中(图7)。排名前10显著性富集差异基因主要涉及4个方面,包括遗传信号响应、环境信号响应、新陈代谢和生物系统(表5)。其中,新陈代谢类最大,生物系统类最小。对unigenes进行KEGG注释和富集分析,系统描述了基因在细胞中的代谢途径和功能,并且揭示了在代谢途径中相互协调的基因,有助于进一步解读基因的功能。