《表4 20对SSR标记基于12份蕨麻材料的遗传多样性参数Table 4 Genetic diversity parameters based on 20SSR markers in 12 P.ans

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《磁珠富集法开发蕨麻SSR标记引物》

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选取了12个地理分布差异较明显的蕨麻材料，提取基因组DNA，利用聚丙烯氨酰胺凝胶电泳进行检测，对40对引物进行了初步筛选，结果显示未扩增出条带的引物3对，17对引物条带不清晰或没有多态性，20对引物（P3、P5、P6、P7、P8、P12、P15、P18、P19、P21、P24、P25、P26、P27、P28、P30、P32、P31、P34、P40）可以扩增出清晰，稳定，且多态性丰富的电泳条带，扩增效率达50%，20对引物已上传至GenBank，登录号详见表4。对筛选出的20对引物扩增结果做了初步分析，筛选出的引物扩增出多态性位点总共为338个，平均每对引物扩增出17个多态性位点，引物P25所扩增出多态性位点最多，为29个，平均有效等位基因数（Ne）为1.244个；多态性信息含量（PIC）大小为0.8234~0.9570，变化范围较小，平均为0.8996；Nei’s基因多样性指数（H）平均为0.1768，最高为0.2521，最低为0.1208；Shannon’s信息指数（I）最高值为0.4020，最低为0.2332，平均为0.3078，各参数详见表4，部分材料微卫星引物多态性分析检测电泳图见图3。利用20对引物扩增结果对12份材料的亲缘关系进行了分析，12份材料UPGMA聚类分析结果表明:参试材料之间具有较为复杂的遗传关系（图4）。