《表1 柞蚕幼虫肠道细菌群落的基本构成》

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《柞蚕肠道细菌菌群结构与多样性》


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5个样品的测序总长度为65 337 603 bp,单个序列的长度在262~477 bp。从中肠和中肠内容物中,分别获得了90 118和62 610条有效reads,其中88 632(98.35%)和62 150(99.27%)条reads可以分配到属的水平。通过i-sanger微生物平台对代表OTUs的序列进行归类,柞蚕中肠和中肠内容物中共发现了10个门、20个纲、40个目、57个科、71个属的细菌,其中中肠共发现81个OTUs,来自10个门、18个纲、38个目、55个科、68个属;中肠内容物中共检测到24个OTUs,来自5个门、9个纲、13个目、16个科、20个属(表1)。在门、纲、目、科和属分类阶元,柞蚕中肠和中肠内容物共有的细菌群落分别是5、7、11、14、17种(图1)。