《表2 樟叶越桔CYP450基因序列相似性比对》

《表2 樟叶越桔CYP450基因序列相似性比对》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《樟叶越桔CYP450基因片段克隆与家族分析》


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BlastX同源性比对分析结果显示(表2),实验推导的21个樟叶越桔CYP450与其他已知物种中的CYP450蛋白具有较高的序列同源性。有11个樟叶越桔CYP450均与来自猕猴桃(Actinidia chinensis)的CYP450蛋白的同源性较高,具体表现为基因序列1、3、7、8、9、10、14、17、18、21和22推导的11个樟叶越桔CYP450分别与来自中华猕猴桃(Actinidia chinensis)的CYP450蛋白PSS31462.1、PSR87948.1、PSR85388.1、PSR96729.1、PSS31380.1、PSS31464.1、PSR94944.1、PSR95001.1、PSS13496.1、PSR91489.1和PSS36215.1具有最高的相似度。基因序列15和16推导的2个樟叶越桔CYP450分别与葡萄(Vitis vinifera)的CYP450蛋白XP_010659055.1和XP_00-2276558.3具有最高的相似度。基因序列2、5、6、11、12、13、19和20推导的8个樟叶越桔CYP450分别与辣椒(Capsicum annuum)(PHT92490.1)、棉花(Gossypium hirsutum)(XP_016743941.1)、川桑(Morus notabilis)(XP_024023002.1)、荷花(Nelumbo nucifera)(XP_010248252.1)、茶树(Camellia sinensis)(AJB846-23.1)、烟草(Nicotiana attenuata)(XP_019237785.1)、紫花风铃木(Handroanthus impetiginosus)(PIN23931.1)和野生橄榄(Olea europaea var.Sylvestris)(XP_0228-89899.1)的CYP450具有最高的相似度。上述21个樟叶越桔CYP450与其他已知物种CYP450蛋白的最高相似度均在56%及以上,最高的达到92%;序列覆盖率均较高,基因序列11和19推导的樟叶越桔CYP450蛋白与比对分析的CYP450蛋白的序列覆盖率分别为66%和71%外,其它19个樟叶越桔CYP450蛋白与比对分析的CYP450蛋白的覆盖率均高于84%(含84%),其中有15个蛋白序列覆盖率达到100%;比对结果的E值都接近于0,表明分析的21个樟叶越桔CYP450序列和比对物种的CYP450覆盖序列几乎完全匹配。