《表1 GEO数据库中4项研究的基本信息》

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《沉默GTSE1基因通过p53通路诱导肝癌细胞凋亡》


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4组基因芯片数据来源于GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds),见表1。利用GEO数据库中内置R程序进行差异表达基因筛选。筛选流程:在GEO网站搜索框中输入编号(Accession number)即可找到每个芯片项目,然后在其数据网页上进行R标签分析;显示前1 000个差异基因,拷贝基因目录及表达差异倍数[即log2处理过的倍数变化(fold change,FC)],并制图;最后通过http://www.biovenn.nl/index.php网页工具制作4组数据的韦恩图,输入数据,输出结果。