《表2 菊芋SUS、SPS和INV理化性质》

《表2 菊芋SUS、SPS和INV理化性质》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《菊芋蔗糖代谢相关产物与关键酶基因对高温的响应》


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注:a、b分别表示跨膜区域以及信号肽的存在。

本研究依托转录组数据,利用电子克隆技术鉴定了2个SUS、2个SPS和7个INV基因,其序列已提交至NCBI GenBank(MK386943-53)(表2)。通过ExPASY-ProtParam tool在线软件分析表明,SUS的氨基酸长度大约为800,相对分子质量约为9.2kD,理论等电点约为6;SPS的氨基酸长度为1000左右,相对分子质量约为11.5 kD,理论等电点约为6;INV的氨基酸长度为500~700,相对分子质量约为6.2~9 kD,等电点大约在5~9(表2)。SUS、SPS和INV的主要平均疏水性(grand average of hydropathy;GRAVY)值约为-0.25、-0.42和-0.24,皆为亲水性蛋白(表2)。此外,利用在线软件CBS预测蛋白磷酸化位点显示,磷酸化位点多发生在苏氨酸(Thr,T)、丝氨酸(Ser,S)和酪氨酸(Tyr,Y)三类氨基酸上(表3)。菊芋SUS与拟南芥、向日葵进行氨基酸序列比对,相似性高达75.36%,在8-554和557-741氨基酸位点之间各含有一个Sucrose-synth和Glycos-transf 1功能结构域,它们分别行使蔗糖合成和糖基化合物(UDP、ADP、GDP或CMP)转移功能(Koch,2004;Hirose et al.,2008)(图1A)。菊芋SPS氨基酸序列与拟南芥、向日葵、油菜相似性高达69.6%,除了拥有Sucrose-synth与Glycos-transf 1功能结构域以外,还拥有催化蔗糖生成的功能结构域S6PP(Lunn et al.,2000)(图1B)。INV含有Glycohydro结构域,属于糖苷水解酶家族(Flach et al.,1992),通过氨基酸序列比对发现,菊芋INV1/6与拟南芥、向日葵的相似度高达81.56%,菊芋INV2/7与拟南芥、向日葵的相似度高达72.33%,菊芋INV3/4/5与拟南芥、菊芋1-FFT和菊芋1-SST的相似度略低,为48.94%(图1C、D、E)。