《表4 注释的差异表达基因数(DEGs)》

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《基于RNA-seq技术的江鳕不同组织转录组比较分析》

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采用EBSeq 1.1.6软件对样品组间的差异表达进行分析，获得二者的差异表达基因集。采用Benjamini-Hochberg方法校正原有假设检验得到的显著性P值，并结合作为差异表达基因筛选的关键指标FDR（false discovery rate）值，以降低统计假设检验中的假阳性。通过比较发现，不同组间差异表达基因数量和注释的差异表达基因数量均呈现出相同的趋势，即肾脏vs肝脏最高、脑vs肾脏次之、脑vs肝脏最低。脑vs肾脏的上调基因数量最多，肾脏vs肝脏的下调基因数量最多（表3；表4）。这些差异基因的富集，为寻找组织特异性表达基因奠定了基础。