《表2 PCR反应体系:灵芝连作土壤真菌群落分析》
按照OMEGA土壤DNA提取试剂盒(D5625-02)说明书,对种植1年、2年、4年灵芝覆土和灵芝博览园邻近的野生土壤DNA进行提取,DNA提取质量通过琼脂糖凝胶电泳进行检测,并采用紫外分光光度计对DNA进行定量(丛娟等2007)。以ITS1为目标区域进行引物设计,使用的引物为ITS1FI2 5?-GAACCWGCGGARGGATCA-3?和ITS2 5?-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3?(Schmidt et al.2013)。通过PCR对目标片段进行扩增,回收采用Axy Prep PCR Cleanup Kit试剂盒。对纯化后的PCR产物采用Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay Kit试剂盒在Qbit荧光定量系统上对相应的文库进行定量。将浓度为2nmol/L以上的各上机测序文库进行梯度稀释后按比例加以混合,经NaOH变性后可进行上机测序;使用MiSeq Reagent Kit试剂盒于MiSeq测序仪进行2×300bp的双端测序(表2、表3)。
图表编号 | XD00119726700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.22 |
作者 | 袁源、黄海辰、叶丽云、傅俊生、吴小平 |
绘制单位 | 福建农林大学生命科学学院、福建农林大学菌物研究中心、福建农林大学生命科学学院、福建农林大学生命科学学院、福建农林大学菌物研究中心、福建农林大学生命科学学院、福建农林大学菌物研究中心 |
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