《表2 医学检验实体词表:医学检验知识的图谱构建与应用》

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《医学检验知识的图谱构建与应用》


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本文从LIS系统记录中的结构化、半结构化和非结构化数据中提取知识。对于结构化数据,由于其数据结构较为规范,如检查报告单中的各检验项,制定实体抽取规则相对容易;而对于非结构化文本数据,如预诊断结论,由于其格式自由,在知识抽取规则上需要借助Natural language processing(NPL)进行处理。本文首先将LIS数据中的实体根据概念层进行实体链接,由此构造出实例层。根据表1,患者“张三”的LIS数据记录可被映射到图2的概念层,实现实例化。例如,患者“张三”病例号属性值“46364062”可以被映射到患者实体类以实现患者实体的实例化。同样,“张三”的姓名、性别和年龄可以被映射到“基本信息”实体进行实例化。与此类推,患者“张三”的其它LIS数据记录都可以映射到图1的树形概念图中,实现医学检验概念图的一次实例化。表2列出本文实例化的数量和分布特征。