《表3 显著富集的GO条目》
得到差异基因之后,对差异基因进行GO和KEGG Pathway富集分析。如图2所示,GO数据库把基因的本体分为三种:物过程(Biological Process,BP)、细胞组成(Cellular Component,CC)和分功能(Molecular Function,MF)。紫色叶与绿色叶比较,富集到差异基因数目最多的是分子功能,富集到差异基因数目最多的功能是结合与催化活性,其中尤其与糖基水解酶活性、葡萄糖苷酶活性和氧化还原酶活性相关的功能富集最显著(表3)。富集到生物过程的差异基因主要集中在细胞过程和代谢过程中,其中最显著富集的功能集中在细胞生长、碳水化合物代谢和激酶活性三方面。我们还注意到其中的GO:0043473、GO:0043476、GO:0043478、GO:0043479和GO:0043480五条term都属于组织中色素积累过程(表3)。
图表编号 | XD00115876900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 刘悦、曲浩、李友勇、段志芬、杨盛美、尚卫琼、矣兵、杨兴荣、孙雪梅、刘本英 |
绘制单位 | 云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶学重点实验室 |
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