《表2 Proteome Discoverer 2.1定量分析参数》

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《SETD2基因敲除前后鼻咽癌细胞中定量蛋白组学研究及差异信号富集》

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质谱分析原始数据为raw文件，用软件Mascot 2.6和Proteome Discoverer 2.1进行查库鉴定及定量分析。MASCOT 2.6数据库搜索相关参数见表1。在定量分析过程中，采用Proteome Discoverer 2.1软件对肽段报告离子峰强度值进行抽提，并对定量值进行归一化处理，相关参数见表2。将表达倍数（FC）≥1.2，P<0.05定义为差异蛋白。对目标蛋白质集合的GO注释可以从参与的生物学过程、具有的分子功能和所处的细胞组分三个方面对这些蛋白质进行分类，通过Fisher精确检验来评价某个GO条目蛋白质富集度的显著性水平。KEGG通路富集分析方法即以KEGG通路为单位，以所有定性蛋白质为背景，通过Fisher精确检验来分析计算各个通路蛋白质富集度的显著性水平，从而确定受到显著影响的代谢和信号转导途径。