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第一章 导言1

1.1 进化论是生物学中最大的统一理论1

1.2 进化论是生物学对自然科学最重要的理论贡献2

1.3 地球生命与地球环境协进化的概念是进化理论的新发展3

第二章 进化(演化)概念与进化生物学5

2.1 时间尺度与历史自然科学5

2.2 进化生物学和进化论5

2.3 广义的进化概念6

2.4 生物进化概念9

第三章 生物进化研究中的方法论问题11

3.1 进化的因果分析11

3.2 进化生物学的比较方法12

1.原理之一12

3.原理之三13

2.原理之二13

3.3 自然历史资料的搜集与分析14

3.4 自然进化过程的考察14

1.极端特殊环境条件下的快速进化14

2.适应辐射情况下的快速进化15

3.环境的急剧变化引起的种群快速进化15

3.5 进化的实验研究15

3.6 关于“现实主义方法”16

第四章 进化思想与进化学说18

4.1 从进化思想到进化学说18

4.2 古代的自然哲学--进化思想的萌芽19

4.3 中世纪西方的宗教哲学--反进化思想21

4.4 近代对立的自然观与进化学说的产生22

1.自然神学22

3.进化论的先驱者与最早的进化学说23

2.近代的进化哲学23

4.居维叶与圣·喜来尔的论战及目的论的衰落25

5.从原型概念到分支概念26

6.灾变说与均变说的对立27

7.历史循环观点与历史进步观点之对立28

4.5 达尔文和达尔文的进化理论29

1.达尔文给我们带来了什么？29

2.达尔文进化理论的形成30

3.达尔文进化理论的主要内容33

4.6 达尔文以后的进化理论的发展36

4.7 关于进化学说之间的争论和进化学说的分类38

第五章 地球生命与生物圈41

5.1 地球是一个特殊的行星，其特殊性就在于它具有由多样生命组成的生物圈41

1.行星上建立一个相对稳定的生物圈的条件44

5.2 地球生物圈的形成44

2.地球生物圈形成和发展过程中起关键性作用的生物45

3.地球生物圈是何时和怎样形成的46

4.生物圈物种组成的进化改变47

5.3 为什么在太阳系中唯独地球具有生物圈48

第六章 进化的历程--生命史51

6.1 生命史中的进化事件51

6.2 生命史研究的新进展和新问题52

6.3 生命史的三个阶段54

6.4 生命起源56

1.关于地球生命由来的四种解释57

2.关于生命的定义58

3.生命起源研究的新进展和新假说62

4.从化学进化到生物学进化65

5.研究生命起源的途径67

6.小结68

6.5 光合作用和光合自养生物的起源及有关的地质记录70

6.6 蓝菌的繁荣与衰落72

6.7 细胞进化--从原核细胞到真核细胞74

6.8 元古宙晚期的生物进化事件和全球环境变化75

6.9 多细胞化和后生动、植物的起源78

1.多细胞化是继真核细胞起源之后的又一重大的进化事件78

2.多细胞生物的结构形式和组织化等级79

3.多细胞植物的起源及有关的化石记录80

4.后生动物的起源和早期动物的适应辐射82

5.促进生物多细胞化的环境和生物因素85

6.10 性和有性生殖的起源87

1.性和性现象87

3.性分化和有性生殖的古生物学证据88

2.性起源于何时？88

4.性起源及其促因90

5.性分化对进化进程的影响91

6.小结92

6.11 显生宙生物进化事件92

6.12 动物骨骼的起源与进化93

6.13 维管植物的起源与早期进化97

6.14 从进化历程看形态进化趋势：复杂性和多样性的增长97

第七章 小进化100

7.1 概念：什么是小进化100

7.2 小进化的基本单位100

7.3 种群的遗传结构101

7.4 小进化因素：引起种群基因库组成变化的原因102

1.适应是生物特有的104

7.5 适应104

2.关于“最适者生存”105

3.达尔文适应度105

4.适应的定义106

7.6 自然选择108

1.在什么情况下发生选择？108

2.选择作用下的种群基因频率的改变108

3.正常化选择110

4.平衡选择110

5.稳定化选择与歧异化选择--两种相反的选择模式112

6.定向选择及小进化的适应趋势112

7.集团选择113

8.性选择113

7.7 自然选择作用下的适应进化及实证114

1.自然选择是适应进化的主要原因115

2.蛾的工业黑化是自然界中自然选择导致适应进化的第一个实证116

3.加拉巴戈斯群岛的达尔文地雀的喙形进化是自然选择作用的新例证117

7.8 自然选择在小进化中的作用(小结)118

7.9 小进化的随机性与决定性120

7.10 小进化中的内因121

1.现代遗传学揭示出基因结构的几个重要特征121

2.具有进化功能的基因122

3.有进化功能的基因是如何进化出来的--红皇后假说与物种选择假说123

7.11 关于定向变异和获得性遗传124

第八章 种和种形成126

8.1 物种问题126

8.2 生物为什么以物种的形式存在？127

1.物种的分异是生物对环境异质性的应答127

2.物种间的不连续抵消了有性生殖带来的遗传不稳定性127

1.模式概念、唯名论概念和群体概念128

8.3 物种的概念与定义128

4.物种是生态系统中的功能单位128

3.物种是大进化的基本单位128

2.非时向的物种概念129

3.时向种概念131

4.关于物种问题的小结132

8.4 种形成133

1.种形成的含义133

2.种形成方式134

3.关于种形成问题的争论139

4.关于种形成方式的小结140

第九章 分类系统与进化谱系142

9.1 分类学与系统学142

9.2 分类学的两种指导思想和两种原则143

9.3 分支系统分析与进化谱系的推断145

1.分支系统学要求建立单源群系统146

2.推断进化谱系的简约性原则147

3.特征分析149

4.进化谱系与分类学矛盾的调和：综合进化分类151

9.4 分子特征与分子进化谱系152

第十章 大进化155

10.1 名词概念156

1.专用术语156

2.大进化的其他名词概念156

10.2 大进化型式157

1.辐射，趋同和平行158

2.渐变型式与断续平衡型式160

10.3 进化速率163

1.进化速率的衡量163

2.形态学进化速率163

3.分类学进化速率164

4.进化速率计算中的误差169

10.4 进化趋势170

1.概念170

2.表型分异与谱系分异171

3.从系统树看进化趋势172

4.造成进化趋势的原因173

10.5 绝灭176

1.概念176

2.认识历史176

3.常规绝灭177

4.集群绝灭与生命史中的“危机”事件178

10.6 大进化与小进化问题讨论188

1.小进化模式能解释大进化吗？188

2.进化与个体发育：关于重演与异时189

3.是否存在大进化的特殊机制？--关于大突变191

4.自然选择是否在生物的不同层次上起作用？192

5.协进化193

第十一章 生态系统进化195

11.1 生物之间的两种联系纽带和两类系统195

11.2 生态系统是随时间而进化的信息系统195

11.3 生态系统的组织化水平196

11.4 在生态系统内的物种进化197

1.物种在生态系统中的地位与作用197

2.竞争、协进化与共存197

11.5 在短时间尺度上生态系统的变化--演替200

11.6 生态系统进化：在地质时间尺度上的生态系统演变200

11.7 生态系统进化幕201

1.太古宙早期201

4.晚元古代203

2.太古宙至早元古代203

3.中元古代203

5.显生宙204

11.8 生态系统进化的趋势204

11.9 人类影响和控制下的生态系统的进化趋势--理智圈的扩展204

第十二章 分子进化和分子系统学207

12.1 概念207

12.2 生物大分子进化的特点207

1.生物大分子进化速率相对恒定207

2.生物大分子进化的“保守性”208

12.3 分子进化中性论：论点和论据209

12.4 中性论与自然选择说是对立的吗？--关于中性论的问题讨论213

4.选择在生物大分子的适应进化中起作用214

3.“选择中性的突变”的选择214

2.分子进化的保守性表明选择仍然起作用214

1.中性论是解释生物大分子进化现象的理论214

5.中性论的贡献215

12.5 分子系统学和分子系统树215

1.原理和概念215

2.构建分子系统树的方法216

3.分子系统学研究的重要成果219

12.6 古分子系统学222

1.古蛋白质分子的研究222

2.古DNA和古分子系统学研究222

3.古DNA和古分子系统学研究的意义和前景225

12.7 分子钟226

第十三章 人类的起源与进化228

13.1 人类具备创造文化的三个基本条件228

1.人的社会属性和社会人的概念229

13.3 人的双重属性和人的概念229

13.2 达尔文把人类回归到自然界229

2.人的生物学属性和自然人的概念230

13.4 人类的形态学特征231

1.人具有脊椎动物的某些原始的形态特征231

2.人类躯体结构保留着树栖生活方式的适应特征231

3.体毛的退化和独特的性行为232

4.镶嵌进化和幼态持续233

13.5 人类的生物学进化234

1.人类进化过程中躯体的改变234

2.躯体进化改变带给人类的利与弊236

3.人类的生物学适应与人类生活方式的改变236

4.脑量的增长237

13.6 人类是一处多态复合种238

2.南方古猿239

1.人科最早的化石代表239

13.7 人科谱系和现代智人种的起源239

3.能人240

4.直立人240

5.智人241

6.关于现代智人种的起源242

7.关于人科谱系的问题243

13.8 从猿到人：关于人与猿的本质区别问题244

第十四章 文化进化与人类未来246

14.1 人类的生物学进化与文化进化246

14.2 文化进化对人类生物学进化的影响249

14.3 人类社会现象和社会行为的生物学解释--关于社会生物学问题的争议250

14.4 进化与人类未来254

后记257

参考文献258