《超循环论》

作者为中译本写的序1

超循环：一个自然的自组织原理 艾根 舒斯特1

前言3

1 超循环的出现9

1.1 进化中的统一性和多样性规范9

1.2 什么是超循环？11

1.3 达尔文系统20

1.4 误差阈和进化42

2.1 具体的问题61

2 抽象的超循环61

2.2 动力学系统的一般分类69

2.3 自组织反应网络的固定点分析77

2.4 基本超循环的动力学106

2.5 超循环与翻译119

2.6 超循环网络128

3 现实的超循环142

3.1 怎样开始翻译？142

3.2 原始编码的逻辑147

3.3 原始编码的物理学154

3.4 GC配对密码161

3.5 早期翻译器中的超循环组织170

3.6 十个问题179

3.7 现实的边界条件196

3.8 进化的连续性202

物质的自组织和生物大分子的进化 艾根208

1 导言209

1.1 “因和果”209

1.2 自组织的前提212

2.1 “信息”概念230

2 唯象的选择理论230

2.2 唯象方程233

2.3 选择约束239

2.4 选择平衡245

2.5 品质因子和误差分布249

2.6 选择动力学253

3 选择的随机处理263

3.1 决定论选择理论的局限263

3.2 平衡态附近的涨落264

3.3 定态的涨落266

3.4 马尔科夫链的随机模型270

3.5 三种选择原型的定量讨论274

4 基于互补识别的自组织：核酸281

4.1 真实的“自我指令”281

4.2 互补指令和选择(理论)286

4.3 互补碱基识别(实验数据)291

5 通过循环催化的自组织：蛋白质304

5.1 酶的识别和催化304

5.2 自组织的酶循环(理论)307

5.3 蛋白质能复制出自已吗？315

6.1 核酸和蛋白质需要协同作用320

6 通过编码催化功能的自我有序320

6.2 自复制的超循环322

6.3 关于密码起源333

7 进化实验343

7.1 Qβ复制酶系统343

7.2 试管中的达尔文进化345

7.3 定量的选择研究349

7.4 “独缺”实验352

8 结论354

8.1 理论的限度354

8.2 “价值”概念355

8.3 “耗散”和“信息起源”358

8.4 选择和进化的原理361

8.5 “非决定”但“不可避免”363

8.6 生命现象能够用现在的物理学概念加以解释吗？367

9 总结369

生物信息的起源 艾根375

1 问题和伪问题377

2 生物的复杂性和特殊性379

3 “生命博奕”387

4.1 稳定性和选择395

4 达尔文和分子395

4.2 随机模型398

4.3 唯象表示402

4.4 进化实验407

5 实在和模型410

5.1 真实自复制411

5.2 互补指令412

5.3 循环催化415

5.4 超循环417

6 一些回答426