《表1 候选中药单体：抗EV713C蛋白酶活性中草药单体的虚拟筛选》

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《抗EV713C蛋白酶活性中草药单体的虚拟筛选》

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分子对接是通过计算小分子化合物与生物大分子的相互作用，预测两者之间的亲和力。本研究使用AutoDock Vina软件，将中药单体与EV71 3C蛋白酶（3SJO）进行分子对接，计算受体与配体之间的结合自由能（affinity）。根据自由能值排序，≤-33.487 kJ/mol的单体有20个，≤-37.673 kJ/mol的单体有2个，筛选结果见表1。结合自由能是识别目标蛋白与小分子配体结合程度的评价标准，自由能值越低，表示二者结合力越强，结合越紧密，形成的复合物越稳定。由表1可见，原花青素B5（procyanidin B5）和1，2，3，6-四-O-没食子酰基-β-D-葡萄糖（1，2，3，6-tetra-O-galloyl-β-D-glucose）等中药单体可能抑制EV71 3C蛋白酶的生物活性。原花青素B5显示出最低的结合自由能，其次是1，2，3，6-四-O-没食子酰基-β-D-葡萄糖，因此二者可能具有较好的抑制作用。