《表3 表达量较高基因中预测的新生抗原》

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《原发性浆细胞白血病肿瘤新生抗原的筛查和预测》

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NetMHC软件预测结果显示，FRG1（NM＿004477:c.A469G，p.I157V）、MLL3（NM＿170606:c C925T，p.P309S）、ZDHHC11（NM＿024786:c.G256A p.V86I）、SVIL（NM＿003174:c.G2901A，p.M967I）这4个基因上的突变可以得到符合筛选标准的新生抗原（即突变所在肽段与HLA分子的结合能力小于500nmol/L，并且小于相应野生型肽段和同一种HLA分子的亲和力），所得的和HLA-Ⅰ、HLA-Ⅱ类分子亲和的新生抗原分别为9、34个。其中，SVIL突变产生的新生抗原都具有良好的水溶性，而其他新生抗原水溶性较差。所有预测到的新生抗原亲和性结合HLA的A*02:01、A*02:06、DQA1*02:01-DQB1*03:01、DQA1*05:10-DQB1*03:01、DQA1*05:10-DQB1*02:02、DRB1*07:01、DRB1*11:01等7个亚型。18个新生抗原能亲和性结合不止一种HLA分子亚型。12个新生抗原与HLA分子的亲和力比它们相应的野生型多肽的亲和力强100 nmol/L以上。FRG1和MLL3的mRNA表达水平较高，且MLL3与多种癌症密切相关，故新生抗原的选择以FRG1和MLL3的突变产生的为优先（表3）。FRG1 I157V产生的新生抗原LLASNSCFV和ALLASNSCFV为HLA的A分子的强结合肽，MLL3P309S产生的新生抗原YHY-SCAAGAGTFQDF、TQMYHYSCAAGAGTF、QM-YHYSCAAGAGTFQ、MYHYSCAAGAGTFQD为DQA1*05:10-DQB1*03:01分子的强结合肽。ALLASNSCFV、TQMYHY-SCAAGAGTF、QMYH-YSCAAGAGTFQ、MYHY-SCAAGAGTFQD与相应HLA分子的亲和力比它们相应野生型多肽的亲和力强至少一个数量级（亲和力值小150 nmol/L以上），这些新生抗原在实际应用时应优先选择。