《表5 甘蓝杂交组合F1代与各自父母本之间差异表达基因在COG各分类中的数量》

《表5 甘蓝杂交组合F1代与各自父母本之间差异表达基因在COG各分类中的数量》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于叶球转录组数据比较的甘蓝杂种优势分析》


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为了分析差异表达基因参与的代谢通路及生物学功能,将差异表达基因进行GO分类(表4)和COG分类(表5)。GO分类包括3大类:生物学过程、细胞组分和分子功能。表4展示了各分类下的10个主要词条,两个杂交组合的F1代与其父母本之间的差异表达基因数量不同,但富集到的主要词条大致相同。在生物学过程分类下的4对比对中,差异表达基因富集到的前两个词条为:细胞过程和单一生物过程,第3位词条C vs A比对为胁迫应答,其余比对为代谢过程。在细胞组分分类下4对比对中,前3个富集词条都为细胞部位、细胞和细胞器。在分子功能分类下的4对比对中,前2个富集词条为联结和催化活性,第3位词条C vs A、C vs B为核酸联结转录因子活性,F vs D、F vs E为转运活动。这些富集途径对甘蓝叶球杂种优势的建立具有十分重要的作用。