《表1 绒毛生长期不同部位皮肤的钙、铁、锌基因表达差异表》

《表1 绒毛生长期不同部位皮肤的钙、铁、锌基因表达差异表》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《内蒙古绒山羊钙铁锌蛋白在毛发生长过程中的表达模式分析》


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注BK:背部,BL:腹部,BS:体侧.

对测序结果分析表明,采用从头组装的方法共得到57,568条长度大于300bp的转录本序列.序列长度总和达到53Megabase,平均长度928bp,N50长度1,397bp.对转录组序列的蛋白质编码区进行预测,共发现24,058个蛋白质编码序列[7].基于从头组装的转录组序列,首先对绒毛生长期不同部位的表达谱进行分析,根据注释结果筛选获得钙、铁、锌相关蛋白基因分别为141个、24个及922个(表1).以腹部样本为对照,分别与体侧及背部的表达量进行比较,结果表明:钙相关蛋白基因表达量上调及下调的个数基本相当.然而锌及铁相关蛋白基因在背部及体侧表达量低于腹部的基因个数显著增多,例如:与腹部相比,背部及体侧的锌相关蛋白表达量上调的分别为343和382个,而出现表达量下调的基因个数分别为570和539个(表1).另外锌相关蛋白的分析结果还发现,共有9个基因表现为组织特异性表达,其中8个为在背部皮肤细胞中没有检测到表达,该8个基因均为锌指蛋白相关基因,1个在腹部皮肤细胞中没有表达,该基因注释功能为锌转运体(zinc transporter ZIP12)(表2) .