《表2 数据质控结果以及SNP位点分析结果》

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《基于多重PCR靶向二代测序的近交系小鼠遗传质量监测方法建立》

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多重PCR靶向二代测序方案，在两端添加的条形码可以一次对上万个样本进行标记，并在单次上样可得全部序列，使得高通量的样本得以快速有效鉴定。在建库过程中，只需几步PCR反应扩增，纯化后可以直接进行测序，建库方便。在费用上，考虑到PCR的试剂费用以及一部分不当损耗，分摊到每个样本，引物加上反应试剂的费用微不足道。同时，测序一个流通槽的费用大约7 000～8 000元，一个流通槽的大小约为90 G，全基因组测序深度为10～30X，所需数据量为30～90 G，而靶向二代测序SNP分型方案的测序深度达到了数百X甚至数千X（表2），100个样本所需数据量为4.5 G，90 G可产生2 000只小鼠的数据。分摊到每只小鼠的测序费用极低。