《表2 小桐子Dof基因:小桐子Dof基因家族生物信息学与表达分析》
利用已经鉴定的拟南芥和水稻Dof基因家族所有成员,通过NCBI小桐子基因组数据库进行BLAST比对寻找,共鉴定出24个小桐子Dof转录因子。为了更好地区分小桐子Dof转录因子,基于Dof基因在染色体上的定位(从上到下),小桐子Dof基因被暂时命名为JcDof1~JcDof24。通过ExPASy网站对Dof蛋白的理化性质进行分析,结果表明,Dof基因开放阅读框的长度从483 bp(JcD-of4,NCBI基因ID为JCGZ_21565)到1 569 bp(JcDof16,NCBI基因ID为JCGZ_12318),对应的编码氨基酸的长度从160至525,蛋白质分子量的大小从18 200至56 500(表2)。此外,通过DNA-MAN5.0软件进一步对24个小桐子Dof蛋白的结构域进行分析,结果表明,小桐子Dof蛋白的结构域是高度保守的,且所有Dof蛋白的结构域均含有CX2CX21CX2C基序,进而构成C2-C2单锌指结构(图1),该结果进一步证明了我们所鉴定的蛋白为Dof家族的成员。
图表编号 | XD0035564500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.28 |
作者 | 唐跃辉、包欣欣、王健、冯荆城、张梦、张慧聪、刘梦兰、王玉瑾、娄慧敏、闫浩、谭结、王清伟、刘坤 |
绘制单位 | 周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室、周口师范学院新闻与传媒学院、周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院新闻与传媒学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院生命科学与农学学院、周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室 |
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