《表3 梨95个BAHD家族成员序列属性分析Table 3 Serial attribute analysis of 95 members of BAHD family from pear》
注:Cyto:细胞质;Chlo:叶绿体;Mito:线粒体;Plas:胞间连丝;Nucl:细胞核;Pero:过氧化物酶体。空白处表示不含有结构域。Note:Cyto:Cytoplasm.Chlo:Chloroplast.Mito:Mitochondria.Plas:Plasmodesmata.Nucl:Nucleus.Pero:Peroxisome.Blank spaces indicate no domains.
根据已经报道的BAHD家族保守结构域[18],利用Pfam网站获得对应的隐马尔可夫模型,以此为目标序列,并利用DNATOOLS软件在梨基因组数据库中进行比对,筛选出梨BAHD基因序列共95个。参照Yu等[12]将BAHD家族成员缩写为ACT的方法,本研究将梨95个BAHD成员分别命名为Pb ACT1~Pb ACT95(表3)。HXXXD和DFGWG为BAHD家族的特征保守结构域,所有成员都同时具有这2个结构域或具有其中一个,说明筛选鉴定的结果是可靠的。与花青素合成相关的BAHD一般还具有YFGNC结构域[12],本研究发现Pb ACT61、Pb ACT68、Pb ACT69、Pb ACT70、Pb ACT72、Pb ACT73、Pb ACT74、Pb ACT75、Pb ACT76、Pb ACT77、Pb ACT80、Pb ACT82、Pb ACT87和Pb ACT91都具有该结构域,说明它们可能参与花青素代谢。
图表编号 | XD0026924900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.10.10 |
作者 | 孙燕铭、李亿红、程曦、李国辉、盛玲玲、金青、蔡永萍、林毅 |
绘制单位 | 安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院、安徽农业大学生命科学学院 |
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