《表2 表型贡献率>20%的水稻耐低温萌发QTLs》

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《水稻种子低温萌发的研究进展》

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水稻种子的低温萌发性是一种数量性状，遗传率高，且存在品种差异，可以构建群体，进行低温发芽力的QTL分析[68]。双单倍体系（DH）、重组自交系（RIL）、回交重组自交系（BIL）和染色体片段置换系（CSSL）等是QTL定位时常用到的作图群体[49]。目前发现水稻的每条染色体上都有与水稻低温萌发相关的QTL。藤胜等[69]最早以窄叶青8号和京系17为亲本发展的DH群体为材料，在第4和第9号染色体上各定位到1个低温萌发相关的QTL，贡献率达到11.1%和12.6%。侯名语[49]以Kimnaze和Dv85为亲本构建的RIL群体为材料，共检测到5个低温发芽力QTLs，分别分布在不同染色体上，贡献率在8.8%～27.1%之间（表2）。Miura等[70]以Nipponbare和Kasalath为亲本构建的BIL群体为材料，以发芽力为指标，定位了5个低温萌发相关QTLs，贡献率在10.1%～14.9%。雷建国[71]以Sasanishili和Habataki为亲本构建的CSSL群体为材料，5℃下进行萌发期耐冷QTL定位研究，在第4、10和11号染色体上分别定位到一个QTL，能够解释15.4%～32.5%的表型变异（表2）。纪素兰等[72]以Kinmaze和DV85为亲本构建的RIL群体为材料，进行低温发芽研究，共检测到11个低温萌发相关的QTLs，其中q LTG-7和q LTG-11可稳定表达（表2）。Jiang等[73]以Kinmaze和DV85发展的F2:3群体为材料，在低温下进行发芽试验，在第2、6、7、11、12号染色体上检测到5个QTLs，其低温发芽力的贡献率在8.8%～27.1%（表2）。Satoh等[74]以Akitakomachi和Maratteli发展的RIL群体为材料，定位了4个与低温发芽率相关的QTLs，分布在第1、3、11号染色体上，其贡献率为5.8%～22.1%（表2）。Fujino等[75-76]利用Italica Livorno和Hayamasari构建的RIL群体为材料，检测到3个低温发芽力QTLs分布于第3、4号染色体上，贡献率为5.5%～35%（表2），其中q LTG-3-1是控制水稻低温发芽势的主效基因，并将其定位于3号染色体上一段长4.8 kb的区域内，功能验证表明q LTG-3-1编码一个由184个氨基酸组成的未知蛋白，能够调节细胞液泡化，提高种子低温条件下的发芽势。