《表1|各种动物的数据信息》
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《成骨细胞特异因子2基因家族的全基因组鉴定、分类及进化分析》
根据从Pfam下载得到的Fasciclin基因家族保守结构域的的Profile HMM文件,利用HMMER 3.0软件的HMMsearch检索斑马鱼、非洲爪蟾、鸡、中华鳖、小鼠、大鼠、黑猩猩及人类全基因组的蛋白质序列文件,以“Trusted cutoff”作为筛选条件,并以e值1e-05做为阈值,获取8个物种中Fasciclin蛋白家族的候选基因。利用InterPro Scan (https://www.ebi.ac.uk/interpro/about/interproscan/)对候选基因进行分析[8],并结合Fasciclin蛋白家族保守结构域的Profile HMM profile信息(PF02469.22),验证其编码蛋白中存在Fasciclin相关结构域,确定8个物种的Fasciclin蛋白家族的目标基因。
图表编号 | XD00226996300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.03.18 |
作者 | 谭婧玉、刘海文 |
绘制单位 | 锦州医科大学附属第一医院、锦州医科大学附属第一医院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |