《表1 按Degree排序的中药-成分-靶点Cytoscape分析结果》
将8味中药、394个成分、359个靶点在Cytoscape中进行分析、做图。由图1可见,8味中药的成分和相关靶点比较多,存在比较复杂的关系。在数据处理过程中发现,部分结构如在TCMIP库中检索到的Dimethyl Camphorate,数据库显示成药性为“好”,但是并没给出相应靶点,为了避免错漏可能有活性的结构,在后续研究中利用Autodock Vina对所有结构和筛选出的关键靶点进行了分子对接。对数据进行分析,中药相关参数按自由度(Degree)排序后如表1所示,甘草Degree最大,预示其可能的活性成分数量最多。同时接近中心性(Closeness Centrality)很大、平均最短路径长度(Average Shortest Path Length)很小,说明其在网络中可能非常重要。当归介数(Betweenness Centrality)很大,说明其可能也在本方剂中起着非常重要的作用。
图表编号 | XD00221130200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 杨子博、李冬冬 |
绘制单位 | 天津市医药科学研究所、天津市医药科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |