《表3 Mp NF-YA启动子顺式作用元件》

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《苹果NF-YA转录因子家族的生物信息学和表达分析》


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为挖掘Mp NF-YA受到的潜在调控因素,我们对其启动子顺式作用元件以及相关的mi RNA进行预测分析。通过启动子分析(表3),我们发现MpNF-YA基因启动子区域存在大量的激素与逆境响应元件,例如ABRE元件(响应脱落酸)、ARE元件(响应低氧)、CGTCA-motif元件(响应茉莉酸甲酯)、ERE元件(响应乙烯)、MBS元件(响应干旱)、P-box元件(响应赤霉素)、TCA-element元件(响应水杨酸)、TGACG-motif元件(响应茉莉酸甲酯)等;在部分成员中还发现存在调控分生组织表达的CAT-box元件、参与防御和胁迫过程的TC-rich repeats元件,以及氮素响应相关的GCN4_motif元件,说明这些基因可能受到多因素的影响。此外,我们对Mp NF-YA相关的mi RNA进行预测(表4),发现影响Mp NF-YA基因表达的mi RNA主要为mdm-mi R169、mdmmi R172等。Mp NF-YA上靶点的存在,表明这几类小分子调节物质在Mp NF-YA功能的调控中发挥重要作用,这与之前在拟南芥(Jones-Rhoades和Bartel2004;Li等2008;Zhao等2011;徐妙云等2016)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula;Combier等2006)、番茄(Zhang等2011)等植物中的研究有相似之处。