《表4 藏鸡线粒体基因组的结构特征》

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《藏鸡线粒体基因组特征及系统发育进化》

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ND:NADH脱氢酶亚基；CO:C氧化酶亚基；*表示基因间隔；负数表示相邻基因间重叠的核昔酸数

Hap1～4每个单倍型挑选1个个体进行线粒体基因组测序，测序数据经过拼接与组装，得到4条线粒体基因组序列，长度均为16 785 bp，经过基因注释后，包含22个t RNA基因、2个r RNA基因（12S r RNA和16S r RNA）、13个编码蛋白基因和1个D-loop区（图1）。T、C、A和G 4种碱基含量分别为23.8%、32.4%、30.3%和13.5%，其中A+T含量（54.1%）明显高于G+C含量（45.9%），表现出明显的对A和T碱基的偏向性。除了8个t RNA （t RNAGln，t RNAAla，t RNAAsn，t RNACys，t RNATyr，t RNASer，t RNAPro，t RNAGlu）和NADH脱氢酶亚基6 （NADH dehydrogenase subunit 6，ND6）基因位于轻链（light strand），其他都位于重链（heavy strand）。藏鸡线粒体基因组中某些相邻基因之间存在重叠和间隔现象，发生重叠的序列共计7处，总长度为31 bp，长度从1～10 bp不等，其中最长的重叠区域位于三磷酸腺苷合成酶8 （ATPase8）和ATPase6基因的重叠序列。发生基因间隔的区域共计17处，总长度为48bp，长度从1～9 bp不等，其中最大的间隔区位于t R‐NALeu和NADH脱氢酶亚基1 （NADH dehydroge‐nase subunit 1，ND1）基因之间（表4）。