《表1 两组供体鸡粪便优势菌群在门和属分类水平的含量比较》

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《SPF鸡粪菌移植对雏鸡肠道菌群和大肠杆菌抗药性的影响》

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注:p:门；g:属；数值用平均值±标准差表示；数据用Student’s t检验，ns表示无显著差异，“*”表示差异显著，P<0.05；“**”表示差异十分显著，P<0.01；“***”表示差异极显著，P<0.001。

通过进化关系及PCo A分析发现两组鸡粪便菌群不同，于是进一步统计两组鸡粪便菌群分类学组成的不同。结果在分类学门（Phylum）水平上，SPF蛋鸡（SPF）主要由厚壁菌门（Firmicutes，59.91%）、变形菌门（Proteobacteria，39.59%）组成；而商品肉鸡（Broiler）的优势菌门也是厚壁菌门（68.31%），而第二优势菌门却为拟杆菌门（Bacteroidetes，25.84%），还含有少量的变形菌门（2.60%），而且两组粪便菌群在变形菌门和拟杆菌门组成结构上存在显著差异，而在厚壁菌门上差异不显著。在属水平上，SPF蛋鸡粪便菌群主要由肠球菌属（Enterococcus，42.56%）、埃希-志贺菌属（Escherichia-Shigella，31.75%）和克雷伯氏杆菌属（Klebsiella，7.02%）组成，而商品肉鸡粪便菌群主要由粪栖杆菌属（Faecalibacterium，13.26%）、别样杆菌属（Alistipes，12.51%）和拟杆菌属（Bacteroides，12.17%）组成，而且这些菌属在两组中的相对丰度都存在显著差异（表1）。