《表2 水稻中部分功能性的非编码RNA Table 2 Functional non-coding RNAs in rice》

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《表观遗传调控及其在水稻中的研究进展》

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近年来，水稻中一些调控重要农艺性状的非编码RNA也陆续被鉴定出来（表2）.Wang et al[78]揭示了miR156、miR529和miR172及它们的靶基因SPL和AP2在水稻株型建成中的调控关系.结果显示，miR156和miR529通过调节SPL基因决定水稻的分蘖和穗发育过程，而SPL14可通过直接调控miR172和MADS34-RCN1的途径来决定穗型发育.研究结果还揭示miR172及其靶基因AP2对提高穗粒数有重要作用，降低miR172或者提高AP2的表达，可以在不改变分蘖数的同时大大增加穗粒数.Duan et al[79]报道水稻中控制籽粒大小和粒重的半显性QTL位点GS2，它编码1个生长调控因子4（Os GRF4），该基因受miR396的调节。当GS2发生2-bp的替换突变后，影响了miR396对其的剪切，导致籽粒增大、粒重增加，从而提高粮食产量。Chen团队发现第1个正调控水稻产量的miRNA，miR397，其过表达可增加谷粒大小，促进圆锥花序的分枝.研究发现miR397通过下调其靶基因Os LAC的表达从而增高谷粒产量。Os LAC编码一种漆酶样蛋白，其与植物对油菜素内酯的敏感性有关[8 0].最近该团队又发现另一个正调控水稻产量的miRNA，miR408，其通过调控蓝铜蛋白编码基因Os UCL8影响植株的光合效率及产量性状[81].在水稻中，Os DCL3a负责生成一些与转座元件相关的24-nt siRNA，这些siRNA控制了一些重要的农艺性状.Os DCL3a缺陷会减少主要来自MITEs的24-nt siRNA，从而导致临近基因的表达增高；这些基因与赤霉素和油菜素内酯的稳态相关，由此导致水稻矮小和旗叶角增大等表型[82].植物的LncRNAs在生殖发育中起重要调控作用，Wang et al[83]通过高通量测序从玉米和水稻中鉴定出一批长链非编码LncRNAs，并结合全基因组关联数据分析，鉴定出上百个与农艺性状相的LncRNAs.