《表1 供试引物序列:土壤消毒结合施用生物有机肥对西瓜病土改良效果的影响》

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《土壤消毒结合施用生物有机肥对西瓜病土改良效果的影响》


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土壤在提取DNA前置于-20℃保存。采用PowerMax?DNA试剂盒(MO BIO Laboratories,Inc.,USA)提取土壤DNA,0.5 g土壤所提取的DNA溶于100μl洗脱溶剂中。尖孢镰刀菌、真菌和细菌数量采用CFX-96实时荧光定量PCR仪(ABI 7500,Applied Biosystems,USA)测定。荧光定量PCR扩增体系为2μl土壤DNA模板,10μl SYBR Premix Ex Taq,10μmol/L正反引物各1μl(尖孢镰刀菌为ITS1F和AFP308,细菌为Eub338和Eub518,真菌为ITS1f和5.8s,表1),6μl无菌去离子水。尖孢镰刀菌反应条件为95℃预变性2 min,95℃变性10 s,58℃退火15 s,72℃延伸20 s,40个循环;真菌和细菌反应条件为95℃预变性2 min;95℃变性10 s,53℃退火20 s,72℃延伸30 s,40个循环。在每一循环的退火阶段采集荧光信号,实时检测并且记录荧光信号的变化,反应结束后制作扩增产物的熔解曲线。建立尖孢镰刀菌、真菌和细菌标准曲线,计算土壤中尖孢镰刀菌、真菌和细菌数量。