《表4 MDM2扩增与未扩增肌层浸润性膀胱尿路上皮癌的表达差异基因》
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《肌层浸润性膀胱尿路上皮癌MDM2扩增与PD-1/PD-L1抑制剂耐药机制TCGA数据库资料分析》
注:up.上调;down.下调;FC.Fold Change,即倍数变化。
使用cBioPortal在线富集分析对比MDM2基因扩增组和未扩增组,MDM2 mRNA水平在前者显著高于后者(P<0.001,q<0.001),进一步获得2组间差异基因集合A(41基因)。使用GeneSpringGX分析获得MDM2基因扩增与未扩增组间差异基因集合B(94基因)(图1A)。2个集合交集含16个差异基因,其中15个基因表达与MDM2基因扩增的相关性有统计学意义,但|r|≥0.3且功能明确的基因仅FRS2、RAB3IP、YEATS4、RAP1B和CPSF6Z这5个(图1B和表4)。CNA数据集中,这5个差异基因的扩增频率为FRS2(8.1%,33/408)、RAB3IP(8.3%,34/408)、YEATS4(4.4%,18/408)、RAP1B(6.9%,28/408)和CPSF6(8.6%,35/408)。其中FRS2、RAB3IP、RAP1B、CPSF6和MDM2同时扩增比例高。
图表编号 | XD00168580200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.28 |
作者 | 顾阳春、贾兆君、张华、徐煜、曹宝山 |
绘制单位 | 北京大学第三医院肿瘤化疗与放射病科、北京大学医学部药学院、北京大学第三医院临床流行病学研究中心、上海思路迪医学检验所、北京大学第三医院肿瘤化疗与放射病科 |
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