《表2 稀释平板法(25N)、原位培养(I)和环境样品(E)的香农-维纳指数(H’)和物种均匀度指数(J)》
注:H′=-∑(Pi)(lnPi);J=H′/lnS
在环境样品中,各真菌类群的丰度存在显著不同,通过传统培养方法,往往丰度较高的类群分离到的频率也较高。我们使用Shannon-Wienner多样性指数和Pielou均匀度指数来估计不同方法得到的真菌群落的多样性和均匀度(表2)。发现环境样品的Shannon-Wienner多样性指数最高(5.45),其次是原位培养(4.80)和25N(2.64),说明原位培养可以得到比传统分离培养更高的真菌多样性,也最接近自然环境的多样性,尽管与高通量测序的结果相比,可能仍然有很多物种不能通过原位培养得到。Pielou均匀度指数也显示,利用原位培养获得的真菌群落均匀度指数(0.85)比25N(0.76)的方法更高,并且与环境样品中真菌菌落均匀度指数(0.90)更接近,同样说明原位培养方法可能有利于解除传统分离方法下生长快的物种对生长慢的物种的抑制作用,使我们可以更多地获得生长缓慢的难培养真菌,使分离获得的真菌类群均匀度更高。
图表编号 | XD00163525600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.22 |
作者 | 周士越、周欣、张志锋、梁俊敏、蔡磊 |
绘制单位 | 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院大学生命科学院、中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院大学生命科学院、中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院大学生命科学院、中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室、中国科学院大学生命科学院 |
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