《表1 草地贪夜蛾中经比对鉴定的病毒》

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《基于高通量测序技术检测草地贪夜蛾病毒多样性》

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草地贪夜蛾宏转录组测序后共得到47 601 773条原始序列，经质控后获得45 565 498条高质量序列。所有高质量序列组装后获得14 255条contigs(201～3 981 bp），所有contigs与NCBI数据库中的病毒序列比对后得到14个病毒科（表1）。在比对得到已知病毒的所有序列中，98.75%基因序列与5个昆虫相关的病毒科，分别为杆状病毒科Baculoviridae、呼肠孤病毒科Reoviridae、分体RNA病毒科Partitiviridae、传染性软腐病病毒科Iflaviridae和弹状病毒科Rhabdoviridae。检测到的植物病毒和细菌病毒相关序列相对较少，仅占所有病毒序列的1.25%，其中比对得到的植物病毒科包括分体RNA病毒科、雀麦花叶病毒科Bromoviridae、帚状病毒科Virgaviridae、蕃茄丛矮病毒科Tombusviridae、花椰菜花叶病毒科Caulimoviridae和长线病毒科Closteroviridae；细菌病毒科包括丝杆噬菌体科Inoviridae、短尾噬菌体科Podoviridae、肌尾噬菌体科Myoviridae和长尾噬菌体科Siphoviridae（表1）。根据病毒核酸类型进行分类发现：双链核糖核酸（double-stranded ribonucleic acid，dsRNA）病毒基因序列所占比例最高，为64.77%；其次比例较高的为正链单链核糖核酸（single-stranded ribonucleic acid，ssRNA），为32.47%；双链脱氧核糖核酸（doublestranded deoxyribonucleic acid，dsDNA）病毒所占比例较少为2.69%；此外还检测到单链脱氧核糖核酸（single-stranded deoxyribonucleic acid，ssDNA）和反转录病毒，但所占的比例极低。