《表2 DEGs数目统计表》
以FDR<0.001且|FC|≥2作为筛选标准,筛选CK与T24、T48之间的差异表达基因,差异表达基因分别有221、499个。T24有58个基因上调表达,163个基因下调表达;T48有77个基因上调表达,422个基因下调表达(表2)。二者共同拥有82个差异表达基因,都与炎症、免疫、防御反应相关。对T24和T48差异倍数Top10差异基因进行功能注释(表3)。T24的Top10差异基因5上调表达,5个下调表达,4个没有具体的基因名;T48的Top10差异基因5上调表达,5个下调表达,3个没有具体的基因名。本研究将T24和T48与对照组再进行比较,寻找攻毒后免疫差异表达基因。T24的免疫相关差异基因为:LOC101-791569、MMP9、LOC101800358、CHRNA4、ZBTB16、FST,结合疫相关基因作蛋白网络图(图1A)。T48的免疫相关差异基因23个,根据蛋白网络图得到关联性高的免疫基因分别是:TLR1-A、RHOH、SYK、TLR7、TLR4、SPI1(图1B)。
图表编号 | XD00156643200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 张旭、吴征卓、姚碧琼、施大军、周碧君、文明、程振涛、王开功、陈国权、田琴、阎朝华 |
绘制单位 | 贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州大学动物科学学院、三穗县鸭产业化建设管理办公室、三穗县鸭产业化建设管理办公室、贵州千里山生态食品股份有限公司、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学 |
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