《表4 从江与天柱白三叶DNA甲基化模式变化》

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《贵州不同地区白三叶基因组甲基化MSAP分析》

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PCR扩增产物的电泳位置在凝胶的某个相同迁移率位置上有DNA条带记为1，无DNA条带记为0，将24对引物转化为01矩阵，然后进行甲基化模式分析。通过24对引物在Eco RⅠ/HpaⅡ（H）和Eco RⅠ/MspⅠ（M）酶切扩增泳道上是否扩增出条带，对6个样本DNA甲基化模式的变化进行分析。按照有扩增带计为“1”，无扩增带计为“0”，可将甲基化模式分为4大类，即A类、B类、C类和D类。A类包含3个亚类，为甲基化位点无变化。DS与HZ白三叶相比，未发生甲基化变化的位点占总甲基化扩增位点数的33.92%（表2）；QL与YJ相比，未发生甲基化变化的位点占总甲基化扩增位点数的38.86%（表3）；TZ与CJ相比，未发生甲基化变化的位点占总甲基化扩增位点数的41.35%（表4）。B类包含5个亚类，表现为甲基化程度降低，即去甲基化。DS与HZ相比，25.29%的位点发生了去甲基化（表2）；QL与YJ、TZ与CJ相比，分别有25.43%和26.28%的位点发生了去甲基化（表3；表4）。C类包含5个亚类，表现为甲基化程度升高，DS与HZ相比，36.79%的位点发生了甲基化事件（表2）；QL与YJ、TZ与CJ相比，分别有31.36%和27.98%的位点也发生了甲基化（表3；表4）。另外，还检测到一种较为复杂的甲基化模式，暂且称之为“未知模式”，并将其归为D类，D类位点的变化率不超过总甲基化扩增位点的5%（表2；表3；表4）。此外，6个地区白三叶之间去甲基化和甲基化模式的变化比较（表5）。