《表1 原始ceRNA网络中排名前10的circRNA和miRNA的拓扑属性》
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《联合TCGA和GEO数据库构建和分析胃癌中circRNA相关的ceRNA网络》
对原始ceRNA网络的拓扑属性进行分析后发现,3个circRNA节点(hsa_circ_0008468、hsa_circ_0005822、hsa_circ_0025842)和3个miRNA节点(hsa-miR-940、hsa-miR-944、hsa-miR-515-5p)在3种拓扑学指标排名中都处于前10%,提示它们为网络的核心节点。根据3种指标对节点进行排序,前10个核心节点的拓扑参数见表1。基于鉴定到的6个核心节点,我们从原始的ceRNA网络中提取了子网络,其中包括3个circRNA、3个miRNA和501个mRNA,共有8对circRNA-miRNA和539个miRNA-mRNA关系对(图4)。
图表编号 | XD00154473600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.31 |
作者 | 李让、廖苑君、孙胜南、蓝树金、赵小蕾、覃继恒、饶绍奇 |
绘制单位 | 广东医科大学公共卫生学院、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学公共卫生学院、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学公共卫生学院、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学公共卫生学院、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学医学系统生物学研究所、广东医科大学医学系统生物学研究所 |
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