《表1 番茄遗传多样性分析》

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《基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析》

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本研究利用两种分子标记对不同番茄亚群进行遗传多样性分析，首先根据番茄的类型将210份番茄预先分为3个亚群，包括樱桃番茄，常规品种和现代品系，随后根据地域来源将127份常规品种进一步分为5个小亚群，包括中国、欧洲、美洲、日本和其他亚群。可以发现不同类型分子标记或者番茄亚群的遗传多样性参数有所差异（表1）。总体来说，SNP检测到较高的基因多样性，然而SSR的PIC略高于SNP。对于3个番茄亚群，两种分子标记得出一致的结果，樱桃番茄具有最高的遗传多样性，其次为常规品种，现代品系最低。对于5个小亚群，两种分子标记检测结果存在一定差异。美洲番茄拥有最高的SNP遗传多样性，而中国番茄拥有最高的SSR多样性，同时这两个亚群的遗传变异均高于其他3个亚群。在3个番茄亚群间，SSR标记检测到12个私有等位基因，SNP标记没有检测到私有等位基因，这说明与SNP标记相比，SSR标记更易在栽培番茄中检测到私有等位基因。