《表4 GO包含的部分序列》
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《低盐胁迫对金乌贼存活、免疫酶活性和基因表达的影响》
注:“√”表示某基因在GO相应分支,“—”表示未发现。
GO可视化分析发现,低盐胁迫对生物过程分支GO:0006464(细胞蛋白修饰过程)、GO:0050794(细胞调节过程)、GO:1901605(α-氨基酸代谢过程),分子功能分支GO:0046872(金属离子结合)、GO:0043168(阴离子配位)和细胞成分分支GO:0043229(细胞内细胞器)等所包含基因表达影响显著(图1a和图1b)。由表4可以看出,生物过程分支细胞蛋白修饰和细胞调节过程中视紫红质(Rhodopsin)log2转换后的差异倍数数值最小,为-6.80;而α-氨基酸代谢过程中双加氧酶(Dioxygenase)log2转换后的差异倍数数值最小,为-1.91。在细胞蛋白修饰、细胞调节和α-氨基酸代谢3个过程,cAMP依赖的蛋白激酶(cAMP-dependent protein kinase)log2转换后的差异倍数数值均最大,为3.82。在以上3个过程中,低盐胁迫对蛋白激酶C末端结构域(PRKCI)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine/threonine-protein kinase)基因表达也产生了显著的影响。分子功能分支金属离子结合中RanBP 9log2转换后的差异倍数数值最小,为-3.56,而KRR 1蛋白log2转换后的差异倍数数值最大,为2.00。阴离子配位中抗炎蛋白膜联蛋白(Annexin)log2转换后的差异倍数数值最小,为-3.56,而cAMP-dependent protein kinase log2转换后的差异倍数数值最大,为3.82。在以上两个功能中,低盐胁迫对Annexin,Dioxygenase,PRKCI,ATP酶(AT-Pase),丙氨酸-tRNA连接酶(Alanine-tRNA ligase)和KRR 1也产生了显著的影响。细胞成分分支细胞内细胞器中南洋杉同源盒蛋白(Homeobox protein araucan)log2转换后的差异倍数数值最小,为-6.14,而cAMP-dependent protein kinase log2转换后的差异倍数数值最大,为3.82。
图表编号 | XD00148434400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 王兴强、沈晔、崔春辉、曹梅、王力、丁雪峰、刘豪杰、秦传新、陈百尧 |
绘制单位 | 江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、江苏海洋大学海洋生命与水产学院、中国水产科学研究院南海水产研究所、连云港市农业农村局 |
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