《表2 九层塔分离纯化内生细菌类群》

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《九层塔内生细菌系统发育分析及生物学功能》


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上文中通过插入序列指纹图谱技术对九层塔植物体内获得的48株内生细菌进行聚类分析,48株内生细菌聚为13个类群,从每个类群中选取具有代表性的一株内生细菌作为代表菌株进行分子鉴定,各类群的代表菌株分别为H1201、H1204、H1211、H1041、H2022、H4103、H4106、H4107、H1412、H4203、H4209、H4211和H4039.以代表菌株的全基因组DNA为模板进行16S rRNA基因的PCR扩增并测序,将测序结果序列在美国国立生物技术信息中心(National center for biotechnology information,NCBI)数据库中进行核苷酸的比对,从中找出已经公开发表且相似度最高的模式菌株,结果见表2.并构建发育树见图2.从图中可以看出,各类群代表菌株均与16S rRNA序列比对同源性最高的模式菌株聚为一类,进一步验证了九层塔内生细菌的系统发育进化关系.