《表1 lncRNA的鉴定》

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《捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关lncRNA的转录组学测序与分析》

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使用带有“u”、“i”、“x”、“j”和“o”的5类代码作为新lncRNA转录本的候选，共鉴定出6 505个新的lnc RNA，其中敏感株6 377个，耐药株6 356个（表1），同时鉴定出16 209个mRNA。对lncRNA与mRNA的结构特征（长度分布、和外显子数目）进行统计，结果表明，长度小于500 bp的lncRNA在总lncRNA中的分布密度较高，占58.4%，而mRNA的长度分布主要集中在大于1 000 bp，占总mRNA的44.0%（图1）。外显子统计结果表明，鉴定出的lncRNA中有很大一部分仅含有1–2个外显子，占lncRNA总数的81.6%，m RNA中的外显子个数分布则较均匀（图2）。利用FPKM值归一化转录本表达量，根据中位数可以看出mRNA表达水平高于lncRNA（图3）。