《表1 15组特征组合编号》

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《GM12878细胞系CTCF活性结合位点的预测》


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因为正集(876个活性位点)与负集(231130个活性位点)位点总数相差过于大,后者是前者的264倍,因此对正集完全保留,负集随机抽取1000个位点,应用SVM(支持向量机)和RF(随机森林)两种方法,利用15组特征组合(见表1)对活性位点进行预测。此时,SVM采用Jackknife(刀切法)检验,RF采用5-fold交叉验证。