《表2 冰冻圈生境中的病毒-细菌比[20]》

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《冰冻圈微生物:机遇与挑战》


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冰冻圈生境营养水平低,生物链很短,因而,病毒对冰冻圈生态系统和物质循环具有重要影响。病毒通过裂解宿主细胞,控制细菌和真菌的多样性和丰富度,并可向环境中释放有机物质;通过基因水平转移,影响宿主细菌演化与进化[13]。近年来,随着病毒宏基因组技术的成熟,冰冻圈病毒的研究成为热点,特别是对南北两极冰川[1 4]、冰架、湖水[15]、土壤[16]和海冰[17]等,进行了较广泛和深入地研究。至今,在南极和北极的各种生境中检测到相对高丰度和多样性病毒,包括噬菌体、环状单链DNA病毒、双链DNA病毒、浸染藻类的phycoDNAviruses和噬病毒体(virophages)等DNA病毒,以及Picornavirales等RNA病毒[18]。在南极Taylor Valley冰穴鉴定到归属于Microviridae科DNA病毒[19]。计算机分析估计在南极冰层湖泊中存在大约10 000种病毒,远高于北美湖泊中的约800种病毒[20]。南极和北极海冰中类病毒粒子(virus-like particles)的密度达到105—108 mL-1[17];在南极海冰冰芯中类病毒粒子平均丰度10.9×105 mL-1,平均病毒-细菌比(virus-to-bacteria ratio)5.3[21,22]。平均病毒-细菌比是了解冰冻圈中病毒丰度及其与宿主关系的指标,尽管不同生境中这一数据变化较大,但是已经收集到的数据表明,南极和北极的冰及冰穴中具有很高的病毒-细菌比(表2)。