《表6 HD9802-9S/R144F2群体SNP数量统计》

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《温敏核不育水稻HD9802-9S育性相关基因的BSA测序初步分析》


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总SNP数量为95%水平的所有SNP数量,包含外显子上导致错译和不导致错译的单碱基替换和内含子上的单碱基突变,有效SNP数量为95%置信水平内导致错译的SNP数量

HD9802-9S/R446F2群体的BSA重测序结果显示,置信水平为95%时,2号染色体上的候选区域上有1988个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖431个候选基因,7号染色体上有15个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖4个候选基因.置信水平为99%时,2号染色体上的候选区域上有1 423个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖361个候选基因,7号染色体上没有导致错义突变的SNP突变位点(表5).HD9802-9S/R144 F2群体的BSA重测序结果显示,置信水平为95%时,2号染色体上的候选区域上有563个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖120个候选基因,7号染色体上的候选区域上有15个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖4个候选基因.置信水平为99%时,2号染色体上的候选区域上有367个导致错义突变的SNP突变位点,覆盖64个候选基因,7号染色体上没有导致错义突变的SNP突变位点(表6).