《表2 复方熊胆滴眼液KEGG富集分析结果》

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《复方熊胆滴眼液治疗急性细菌性结膜炎作用及其机制的网络药理学分析》


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将192个化合物靶点与85个疾病靶点,导入String数据库,去除无相互作用的靶点,最后得到一个由215个节点和1 945条边组成的网络,平均节点度为18.1,网络密度为0.54。选取combined score>0.9的边(edge,即蛋白的作用关系),共筛选出由36个化合物作用靶点[分别是SRC(34),MAPK3(33),MAPK1(32),TP53(32),EGFR(31),PIK3R1(30),IL4(30),JUN(30),VEGFA(30),IL1B(29),TNF(29),JAK2(26),MAPK14(29),PIK3CG(28),MAPK8(28),HGF(27),HRAS(25),APP(25),PLG(24),CCL2(24),RHOA(23),VCAM1(22),LCK(21),JAK3(18),SELE(16),CHRM1(12),HTR2A(10),ADRA1B(9),GHR(9),CHRM3(9),BTK(9),ADRA1A(9),ADRA1D(8),CSF2RB(7),B4GALT1(2),B4GALT4(2)]和15个疾病靶点[(分别是STAT3(29),ICAM1(26),SYK(20),IL6R(14),LGALS3(12),PTAFR(12),HRH1(10),TIMP3(9),KRT8(8),LUM(7),ORM2(6),ORM1(6),MAPKAPK2(6),KRT5(4),MKL1(1)]组成的关键靶点集。将上述51个靶点组成的靶点集导入String数据库,得到一个由51个节点、461条边组成的网络,平均节点度为18.1,网络密度为0.801,网络密度增加,说明该网络较之前的大网络(网络密度为0.54)更重要。对该网络进行GO、KEGG富集分析,GO分析结果显示,该复方熊胆滴眼液调控了包括转运、细胞迁移、白细胞迁移、细胞或亚细胞成分的运动、对有机氮化合物的反应、先天免疫反应、细胞定位、防御反应、对有机物的反应、细胞表面受体信号通路等789个生物过程,以及影响蛋白质结合、G蛋白偶联受体活性、受体结合、磷酸酶结合、非跨膜蛋白酪氨酸激酶活性、信号传感器活动、酶结合、α1-肾上腺素能受体活性、MAP激酶活性、磷酸酶结合等55个分子功能。KEGG分析显示,51个关键靶点主要富集的KEGG通路如表2所示,信号通路为按出错率(false discovery rate,FDR)由小到大排列,前10位的通路见表2,提示复方熊胆滴眼液治疗结膜炎与调控Proteoglycans in cancer、TNF signaling pathway、Fc epsilon RI signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway等多条信号通路有关。