《表1 训练集总结：基于迁移学习的MHC-I型抗原表位呈递预测》

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《基于迁移学习的MHC-I型抗原表位呈递预测》

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预训练模型用到的阳性集来源于Pearson等[21]和Bassani-Sternberg等[22]产生的数据以及SysteMHC质谱多肽数据库[23]。将这些数据集合幵后，剔除长度小于8以及大于14的多肽，然后根据多肽和HLA分型去重，总共得到接近16万的多肽数据（表1）。阴性集来源于人类蛋白组的随机切割的多肽（剔除出现在阳性数据集中的多肽），从中挑取与阳性集等量的阴性多肽与阳性集合幵构成训练集，然后从训练集中各挑取5000条阳性多肽和5000条阴性多肽构成验证集。