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目录1

译者前言1

第一章导论1

序言2

第二章微生物的碳循环4

2.1 引言4

2.2有机碳化合物的生产(初级生产)4

2.2.1有关碳的生物化学循环及初级生产力的研究方法5

2.2.2能推断以往生态系的分子生物学方法7

2.2.3初级生产力的演化7

2.3有机物的降解13

2.3.1 “耐蚀性”有机碳化合物的降解14

2.3.2有氧的和缺氧的降解途径14

2.4碳同位素的分馏21

2.5共生生物中的碳关系23

2.6全球的碳循环38

第三章微生物的氮循环41

3.1 引言41

3.2有机氮的矿化作用43

3.3铵的氧化作用49

3.4异化硝酸盐的还原作用53

3.5同化硝酸盐的还原作用55

3.6同化的分子氮的还原作用(固氮作用)55

3…沉积物的氮循环56

第四章微生物的硫循环58

4.1 引言58

4.2硫酸盐还原细菌59

4.3沉积物中的硫酸盐还原细菌60

4.4沉积物中的硫酸盐还原作用63

4.5调节硫酸盐还原作用的因素66

4.6无色硫细菌67

4.7光合自养硫细菌68

4.8沉积物中硫化物的氧化作用69

4.9金属硫化物的形成及氧化73

4.10硫循环一例75

第五章微生物的硅循环77

5.1引言77

5.2地球化学78

5.3微生物与硅的循环80

5.3.1研究方法81

5.3.2硅质化合物的生物降解作用83

5.3.3硅酸盐和硅质矿物的形成91

5.4硅藻和水体的硅循环96

5.4.1 引言96

5.4.2在人工培养和水体生境中硅藻内硅的生理作用和生物化学作用96

5.4.3硅质结构的形成和溶解98

6.1 引言101

第六章微生物的铁循环101

6.2铁的化学性质103

6.3微生物与铁的相互作用105

6.3.1铁的吸收、溶解和稳定化105

6.3.2细菌对铁的氧化和聚集107

6.3.3微生物对铁的还原作用116

6.3.4细菌成因的磁铁矿建造117

6.3.5微生物对铁的间接影响118

6.4微生物的铁循环118

第七章微生物的锰循环120

7.1引言120

7.2锰的化学性质、丰度和分布122

7.3锰细菌的实验研究126

7.3.1锰迁移的间接机制126

7.3.2锰氧化的直接催化作用126

7.3.4锰氧化作用的生理学127

7.3.3锰还原的直接催化作用127

7.3.5锰还原作用的生理学128

7.3.6锰细菌及其沉淀物的结构研究129

7.4生物地球化学活性的判据130

7.5锰活化细菌的丰度和分布130

7.6活性测定135

7.7小结137

第八章微生物的风化作用138

8.1 引言138

8.2研究和测量矿物微生物风化作用的方法139

8.2.1分批菌种培养139

8.2.2实验室和野外用的灌注和渗析装置139

8.2.3研究根围中微生物风化作用的模式140

8.2.4富集、计数和平皿的培养技术141

8.3矿物微生物风化的主要机制和矿解效应142

8.2.5矿物微生物风化作用的测量142

8.3.1酸解作用143

8.3.2络解作用145

8.3.3不同酸类对矿解作用影响的比较147

8.3.4碱解作用147

8.3.5铁和锰的还原作用147

8.3.6离子的交换吸收149

8.4影响微生物风化的一些因素151

8.4.1微生物种151

8.4.2营养不足可能引起的刺激效应151

8.4.3矿物的性质和颗粒大小152

8.4.4水浸效应153

8.4.5抗菌化合物的影响154

8.5矿物的微生物风化作用的意义155

8.5.1土壤的形成和降解作用155

8.5.2根围的微生物风化作用和植物的生长156

8.5.3微生物风化作用的地质意义及其应用158

第九章微生物和沉积物的成岩作用159

9.1成岩环境159

9.1.1引言159

9.1.2温度和压力的变化159

9.1.3物理压实作用160

9.1.4结核161

9.1.5沉积物成分的变化和沉积环境162

9.1.6孔隙水163

9.1.7化学活动性163

9.2微生物控制下的化学反应和矿物反应164

9.2.1引言164

9.2.2低氧成岩作用:带状序列1164

9.2.3近岸沉积物中的成岩作用:带状序列2166

9.2.4沉积物孔隙水中的可溶性有机质167

9.2.5有机质的变化:生油的潜在能力(潜势)168

9.2.6矿物转变1:现代沉积物中的矿物转变169

9.2.7矿物转变2:地质记录中矿物转变的证据171

9.3尚未解决的一些问题172

第十章古微生物生态系174

10.1引言174

10.2资料的性质174

10.2.1微化石174

10.2.2叠层石175

10.2.3沉积地球化学的证据176

10.3叠层石生态系177

10.4非叠层石生态系182

10.5早期生物的、地质的和大气圈演化的一个简要模式185

10.5.1太古宙185

10.5.2元古宙187

10.6 小结189

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