本研究亟需解决的两大问题为：第一，研究农业发展进程中的农业产业组织体系演进的一般规律、发展模式、基本功能与优化特征，揭示其理论依据、内在逻辑和发展路径。第二，研究以合作社为核心的农业产业组织体系创新与优化。揭示农民合作组织的作用机理、产业契合与制度创新，寻求其在一定的外部环境、具体产业与环境条件下，与相关产业组织、经营机制、服务体系的创新模式与制度安排（体制机制与政策措施）。

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