本书分上、下两篇共11章。上篇为海洋微生物基础，主要介绍海洋微生物的基础知识；下篇为海洋药源微生物及其活性物质，按海洋古菌、海洋细菌、海洋原核藻类、海洋真菌、海洋特殊环境微生物等介绍海洋药源微生物和活性代谢产物及其功效等，共收录海洋药源微生物317种（株）。

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