全书三十卷。序例两卷：记录该书编纂始末、体例，以及有关药物应用配伍、汤散应用原则、剂量标准等药物理论的论述。卷三至三十，按照药物性质、产地、采摘时间、与相近似药物的鉴别及药用价值等，进行了系统的分类记录：卷三至五，玉石部上中下品，计253种；卷六至十一，草部上中下品，计447种；卷十二至十四，木部上中下品，计263种；卷十五，人部，计25种；卷十六至十八，兽部上中下品，计58种；卷十九，禽部三品，计56种；卷二十至二十二，虫鱼部上中下品，计187种；卷二十三果部三品，计53种；卷二十四至二十六，米谷部上中

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