《物种之谜》讲述了一个刚从大山里走出来的高一学生红旗对生物充满兴趣、学习生物知识的故事，为读者展现了一个奇妙的生物世界。图书重点关照的是自然界中的物种的多样性、人与自然的和谐发展。书稿在最后表达了对目前人类生存环境的担忧，使图书多了一层科学人文主义的关怀。

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