《表1 6个cDNA文库测序质量和比对信息统计分析》

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《乏情和发情初产母猪下丘脑–垂体–卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析》

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6个文库测序获得的Raw reads进行质控处理获得Clean reads，用Tophat（v2.0.14）软件把每个样本的Clean reads比对到猪参考基因组（Sus scrofa 11.1）（表1）。用Cufflinks（v2.2.1）把比对上的片段拼接成转录本（GTF格式），把来自乏情组和发情组的6个Cufflinks拼接转录本用Cufflinks软件包中的Cuffmerge融合成1个非冗余转录组，后续用这个非冗余转录组来鉴定novel lincRNAs。