《表2 6个文库中获得的tag数量》

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《基于RNA-Seq技术分析植物激素信号途径在水稻幼苗中对低温胁迫的应答规律》

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注:J0、10J3和10J24分别表示02428品种10℃处理0 h、3 h和24 h；I0、10I3和10I24分别表示特青品种10℃处理0 h，3 h和24 h。

在本研究中，我们对特青和02428在10℃处理0、3和24 h三个时间点的样品进行测序，在6个测序样本中，clean tag的数量在总tag中的占比均超过97%。将clean tag与粳稻品种日本晴的参考基因及参考基因组进行比对，成功注释到参考基因的tag数占总tag的比例均达到82%以上（表2），其中注释到单一参考基因的tag数占总tag数比例达44%以上。在测序饱和度分析中，测序量达到2 000 000时，检测到的基因数趋近饱和，而本研究中的六个样本测序量均超过2 000 000，说明样本的数据饱和度很好，可以用于基因的表达模式分析。